1. Các phòng chức năng thuộc Trung tâm y tế, gồm có:

– Phòng Tổ chức – Hành chính;

– Phòng Kế hoạch – Nghiệp vụ (bao gồm cả lĩnh vực quản lý chất lượng, công tác xã hội);

– Phòng Điều dưỡng;

– Phòng Tài chính – Kế toán.

– Phòng Dân số – Truyền thông và Giáo dục sức khỏe;

2. Các Khoa chuyên môn thuộc Trung tâm Y tế, gồm có: 

– Khoa Nội;

– Khoa Ngoại- Phẫu thuật – Gây mê hồi sức;

– Khoa Chăm sóc sức khỏe sinh sản và Phụ sản;

– Khoa Cấp cứu – Hồi sức tích cực và Chống độc;

– Khoa Nhi;

– Khoa Truyền nhiễm;

– Khoa Y học cổ truyền và Phục hồi chức năng;

– Khoa Răng hàm mặt – Mắt – Tai mũi họng;

– Khoa Khám bệnh;

– Khoa Xét nghiệm;

– Khoa Chẩn đoán hình ảnh;

– Khoa Dược – Trang thiết bị – Vật tư y tế;

– Khoa Kiểm soát nhiễm khuẩn;

– Khoa Y tế công cộng – Dinh dưỡng và An toàn thực phẩm;

– Khoa Kiểm soát bệnh tật và HIV/AIDS – Tư vấn v Khoa Y tà điều trị nghiện chất.